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(王宁)7月3日,在“2018全球海洋研究所领导人会议”上,青岛国家海洋科技先导实验室(以下简称国家海洋先导实验室)发布了海洋天然产物3D结构数据库,3.1万个海洋天然产物的精确3D结构等重要数据将向世界开放共享。
海洋是医药资源的巨大宝库。迄今为止,已发现约30,000种结构新颖、活动多样的海洋天然产物。由国家海洋先导实验室、青岛海洋生物医学研究所和中国海洋大学联合开发的首个海洋天然产物三维结构数据库,包含约31000个精确的海洋天然产物三维结构,可直接用于虚拟筛选和智能药物设计。
“建设‘蓝色药房’是人类的共同事业,需要国际社会的参与。我们开放数据库,希望造福人类健康。”国家海洋药物先导实验室学术委员会主任、中国工程院院士关华时表示,该三维结构数据库是“蓝色药物库”的基础数据库,将提高海洋药物开发的速度和效率。
海洋先导国家实验室海洋创新药物筛选与评价平台主任杨金波表示,全球海洋药物研究面临的主要问题是资源获取问题。如何从成千上万种天然产物中筛选和开发新药,是建立“蓝色药物库”的关键。两年后,来自美国、英国、法国、澳大利亚等国的18个团队和100多名专家合作解决关键问题,通过从海洋微生物、矿物和动物中提取天然产物,构建了精确的三维结构数据库。目前,海洋先导国家实验室已经完成了170多个fda批准的肿瘤药物靶点,准确筛选了海洋化合物数据库,发现了1000多个有前途的抗肿瘤药物分子。经过有机合成、生物测定、药理功效分析和临床前试验,发现了许多可开发成海洋药物的先导化合物,海洋药物筛选的准确率从20%以下跃升至70%以上。
国家海洋试验实验室高性能科学计算和系统仿真平台主任危志强表示,海洋自然产品三维结构数据库的发布反映了几个方面的交叉。首先是平台的交叉。两个重要平台——新药筛选平台和超级计算平台——的交叉整合,使得三维数据库的构建成为可能。第二个交叉点是学科的交叉点,药物的研发和信息领域的超级计算机。事实证明,传统新药的研发周期大约需要10到15年,成本在10亿到15亿美元之间。超级计算可以大大降低成本,缩短周期。这些交叉整合也是海洋试点国家实验室平台效应的集中体现。
《人民日报》(2018年7月11日,第16版)
标题:我国发布首个海洋天然产物三维结构数据库
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